Exemple de pouvoir association

A. Mendoza Par conséquent, il est nécessaire de génotype seulement un sous-ensemble de loci pour capturer une grande partie de la variation commune dans le génome. Dans la conception de ces études, deux décisions fondamentales doivent être prises: quels loci à génotype, et combien d`individus. Bien que la couverture soit simple à estimer, la puissance est une fonction compliquée de l`ensemble des SNP sur la puce, la taille de l`effet, et la taille de l`échantillon, et ne peut être évaluée par simulation. Nous avons décrit en détail notre méthode de simulation, HAPGEN, pour la production de grands échantillons de cas et de données de contrôle à chaque SNP HapMap, qui imite les modèles de diversité et de LD présents dans les données HapMap. La couverture est mesurée à un seuil dur: donc si SNP a R2 de 0. Cette recherche a été appuyée par le financement et les subventions du Wellcome Trust (DP et CS), d`un prix du mérite de la société Wolfson-Royal (DP) et de l`EPSRC (ZS). Illumina (www. Pour un SNP donné supposé être causal dans un modèle de maladie particulier et des tailles d`effet, il est facile de calculer les fréquences de génotype dans les cas à ce SNP. La couverture d`un marqueur unique a été définie comme étant la proportion de toutes les variations (avec une fréquence allèle mineure supérieure à 5%) en R2 avec un SNP sur la puce génotypie au-dessus de 0.

Sous réserve de soins dans leur utilisation, la disponibilité croissante des ensembles génotypés de contrôles promet de faire de cette possibilité une valeur d`investigation pour de nombreuses études. Par exemple, l`ajout d`un contrôle 2000 supplémentaire à une étude cas-témoins avec une taille d`échantillon de 1000 à 1000 augmente la puissance pour détecter un effet de 1. Mais qu`en est-il du troisième type de puissance de Lukes-le pouvoir de fixer des intérêts, de prévenir les conflits en altérant les intérêts, etc. Notre programme de recherche et développement de l`acte offre des bourses et des subventions de projet. Des méthodes multi-marqueurs, qui utilisent des combinaisons de SNP, ont été suggérées comme un moyen efficace d`augmenter à la fois la couverture et la puissance [15]. En général, les puces Affymetrix ont plus de redondance que ne les puces Illumina, dans le sens de contenir des ensembles de SNP qui sont corrélés les uns avec les autres. Les sources d`énergie utilisées pour fabriquer de l`électricité peuvent être renouvelables ou non renouvelables, mais l`électricité elle-même n`est ni renouvelable ni non renouvelable. La figure 4 illustre les différences de structure de corrélation pour deux puces. À l`autre extrême, pour les SNP rares, à moins que la taille de l`effet est très grande, la puissance serait faible, même si le PNT avait un proxy parfait sur la puce.

Le paquet fonctionne en ajustant un modèle linéaire généralisé aux résultats de l`étude de simulation et en utilisant le modèle adapté pour prédire la puissance pour un nombre donné de cas et de contrôles. Ces projets comprenaient trois projets éoliens marchands, allant de 150 à 200 MW de capacité et un grand projet de gaz naturel marchand. Pour les tailles d`effet en haut de cette plage (1. Immédiatement apparente est à quel point, pour les études dans les populations caucasiennes, les puces de génotypage suivre la puissance offerte par l`idéal “puce complète” dans un modèle d`étude et de la maladie.